平行板纳米通道中生物分子迁移的分子模拟

编号：NMJS03238

篇名：平行板纳米通道中生物分子迁移的分子模拟

作者：刘坤； 张晓玲； 肖松文； 巴德纯；

关键词：分子模拟； 纳流控； 蛋白质分子； 离子； 迁移特性；

机构： 东北大学机械工程与自动化学院； 首都航天机械公司；

摘要： 基于GROMACS程序包,建立了蛋白质分子和离子在平板型纳米通道内的流动模型,对3.1 nm高的平行板纳米通道内的迁移过程进行了分子模拟,并对均方根偏差分布、水分子密度分布、离子浓度分布等模拟结果进行了讨论.结果表明:水分子在壁面附近出现分层现象,并且形成致密层,密度达到2 500 kg/m3,在中间区域分布平稳;蛋白质分子在离子和电场作用下做翻转和平移运动,沿着电场方向通过管道;通过比较通道表面带电和不带电两种情况下的粒子分布,得出通道壁面对溶液中离子的静电作用是出现"电荷倒置"现象的原因.